膽管結石的最佳治療方案首選手術治療，根據膽管結石所在部位不同，手術方案略有不同。肝外型的膽管結石，在膽總管、肝總管或者一級、二級膽管的膽管結石，需要膽總管切開取石甚至用膽道鏡輔助取石，這個技術就基本上可以清除膽管所有結石。 結石不是長在肝外，長在肝內，有些膽管結石長在膽管的末梢，通過膽總管切開、膽道鏡很難把石頭取干凈，如果石頭局限在某一段或者某一葉，手術方案是部分肝段或者肝葉的切除，達到根治膽管結石的作用。