系統性紅斑狼瘡目前尚沒有根治的辦法，在治療上強調個體化治療。合理的治療可以使系統性紅斑狼瘡患者達到長期緩解。治療的原則是在急性期應積極使用藥物誘導疾病緩解，盡快控制疾病活動。病情穩定后，再調整藥物，并維持疾病的穩定狀態，保護重要器官功能，減少藥物的副作用。 治療主要包括藥物治療和非藥物治療。非藥物治療主要是防曬、注意休息、心理支持等治療。藥物治療包括抗瘧藥、糖皮質激素、非甾體類消炎藥，及免疫抑制劑。病情危重或治療困難的患者可根據病情，給予靜脈注射大劑量的免疫球蛋白、血漿置換等。另外，近年來生物制劑也逐漸運用于系統性紅斑狼瘡的治療，比如抗CD20單抗，包括利妥昔單抗。總體而言，治療中做到遵從醫囑，規范治療，定期隨診，大多數的患者都能夠獲得良好的控制。因此最佳的治療方案就是醫生的個體化診療策略與病人的密切配合。