漱口水分為兩大型，一種是保健型，一種是治療型。保健型會讓你覺得口氣清新，沒有其他作用，但是治療型有藥物作用 。治療型漱口水長期使用對口腔有害，會使口腔菌群失調，口腔黏膜可能會破損甚至是潰瘍。部分漱口水長期使用會導致色素沉著，如常用的洗必泰漱口液，長期使用會使牙齒變黑著色，甚至舌頭也會跟著一起著色。長期使用漱口水也可能會抑制口腔唾液腺分泌，使味覺變差口腔也有輕微灼痛感。外用的漱口水不能代替刷牙，部分人長期使用漱口水不刷牙，造成牙齒表面牙菌斑堆積，更容易損害牙齒和牙周，切記漱口水不能代替刷牙，它只是口腔護理輔助用品。漱口水也只能含漱不能吞服，對于特殊的患者比如兒童、妊娠期、哺乳期的孕婦是慎用。治療性的漱口水必須在醫生指導下使用。