先天性心臟病是由于胎兒心臟在發育過程中受到干擾，使部分發育停頓或缺陷，以及部分該退化者未能完全退化所致，主要病因有： 1、環境因素：胎兒周圍的環境因素可以導致先天性心臟病的發生。妊娠早期子宮內病毒的感染，常見以風疹病毒感染居多，常引起動脈導管未閉或者肺動脈口狹窄，其次為柯薩奇病毒感染可引起心內膜彈力纖維增生癥，此外羊膜病變、胎兒周圍機械壓迫、母體營養障礙、維生素缺乏及代謝病，母體用細胞毒類藥物或較長時間放射線照射，均可與本病發生有關；　　 2、遺傳因素：5%的先心病患者發生于同一家族，其病種相同或者近似，可能由于基因異常或染色體畸形所致； 3、缺氧：高原地區動脈導管未閉及房間隔缺損發病率較高，發生可能與缺氧有關； 4、性別：有些先天性心臟病有性別傾向。