對于甲狀腺癌的治療，最基本或者應用最廣泛的藥物就是左旋甲狀腺素。甲狀腺素目前最常見的就是優甲樂，部分醫院也會用雷替斯，其有效成分都是左旋甲狀腺素，可以通過內分泌治療來抑制分化型甲狀腺腫瘤的復發，是最常用的甲狀腺癌術后藥物。此外，還有一些相對用得比較少的藥物，比如一些分子靶向藥物，對一些難治性的甲狀腺癌，比較晚期的甲狀腺癌，也可以根據不同的分子靶點，使用一些分子靶向藥物，包括甲狀腺髓樣癌的病人，可以根據RET基因是否有突變，來應用侖伐替尼這樣一些分子靶向藥。還有一種就是碘-131，即放射性碘的藥物治療，對于相對比較晚期的或者有殘留的、淋巴結轉移比較多的、有遠處轉移的，這樣一些分化型甲狀腺癌病人，也可以用碘-131做一些清甲或者清灶的治療。所以甲狀腺癌的藥物治療，主要是以內分泌治療的左旋甲狀腺素為主。