核磁共振與CT的區別在于核磁共振沒有電離輻射，它是通過原子核在磁場中產生了信號，通過計算機重建處理，然后成像。核磁共振可以多方位多角度的成像，核磁共振對軟組織的分辨率比較高，對比度也比較高，主要用于中樞神經系統疾病的診斷，用于脊柱、脊髓疾病的診斷，對于關節病變的診斷，磁共振優于CT。 但是磁共振檢查相對CT檢查時間比較長，它不適合急癥及危重病人來檢查，同時有幽閉恐懼癥的患者不適合做磁共振檢查，體內有金屬植入物的患者也不適合做磁共振檢查，但是鈦合金可以檢查。CT主要缺點是有電離輻射，這是CT的是最大的一個缺點。 但是CT檢查的效率比較高，檢查價格相對磁共振來說也要低一些。CT的圖像后處理功能比較強大，后處理做出二維、三維的圖像。CT它相對磁共振的優勢在于CT對骨性病變，鈣化性病變比較敏感，CT對呼吸系統病變的診斷優于磁共振。