扁桃體炎的主要致病菌為乙型溶血性鏈球菌，非溶血性鏈球菌、葡萄球菌、肺炎鏈球菌、流感桿菌以及腺病毒等也可以引起本病。扁桃體炎在臨床上選用抗生素治療，青霉素為首選。像一代、二代的頭孢是次之選用的，頭孢克肟膠囊屬于第三代頭孢，主要對革蘭氏陰性菌比較敏感。應用青霉素治療2-3天沒有效果，需要分析原因，必要時候可以做細菌培養。如果感染為革蘭氏陰性菌，或者細菌培養出來以后，對頭孢克肟比較敏感，可以選用頭孢克肟來治療。首選的時候，一般不選用頭孢克肟來治療扁桃體炎。