CT射線指CT球管發射出的X射線，X射線對人體的危害主要來自電離輻射，可與人體組織細胞和體液作用，破壞機體的一些大分子結構，例如蛋白質、DNA分子，甚至直接損害細胞的結構，累積較大劑量時還會產生致癌和致畸的作用。籠統的講，X射線對人體的危害主要有直接的損傷、致癌和致畸三個方面，但要產生這樣大的危害，必須要射線輻射累積達到一個較大劑量。 照射劑量的多少和CT掃描的曝光條件和曝光時間密切相關。最新研究表明，輻射劑量限量一般要求＜100mSv，＞100mSv才有可能引起不確定的效應。正常用于人體檢查的CT掃描射線的劑量都遠遠小于這個限量，屬于安全范圍內，通常1年做2-3次CT掃描不會對人體產生影響。但人體一些對射線比較敏感的器官，例如甲狀腺和性腺，在做CT檢查時還是要注意做好防護。備孕中女性，特別是懷孕初期的女性要盡量避免接受CT檢查。