孕期卵巢囊腫需根據不同性質采取不同治療，如果在孕早期發現生理性囊腫，單純隨訪即可。如果孕期發現卵巢實性腫塊，不排除惡性，需考慮在孕中期手術。孕期同時發現畸胎瘤的患者，也建議在孕中期即3個月后進行手術治療。 以前的觀念是孕期手術盡量不做，怕影響小孩子的發育及繼續妊娠的情況，但在臨床過程中經常發現妊娠期合并畸胎瘤，合并5-6cm的卵巢囊腫，隨著孕周增長、子宮增大，在牽拉過程中可能出現扭轉的情況，扭轉發生后患者會出現劇烈腹痛，特別是在中晚孕期時，處理會相當棘手，所以在孕中期即3-6個月之間，特別是子宮沒有特別大時，可采取腹腔鏡微創下將囊腫剝除，避免在更大的孕周出現扭轉情況。腹腔鏡手術相對較安全，對于妊娠合并卵巢囊腫的患者，特別是畸胎瘤易扭轉者，需考慮根據其大小來決定孕中期是否進行手術治療。