頭顱MRI平掃是掃常規序列，如T1加權、T2加權、FLAIR或者有時會加彌散成像， 如果這些序列完成后，診斷醫生出具的報告是未見明顯異常，可以排除頭顱很多病變，但不一定說明頭部沒有病變。如果頭痛是由于情緒影響，腦形態正常，信號沒有改變。如果頭痛是血供異常引起，如一過性腦供血不足，可能供血不足時癥狀明顯，但是磁共振檢查時沒有發病，信號沒有改變。 部分病變平掃沒有發現，建議患者做增強掃描，尤其患者有其它不能解釋的明顯癥狀，應該進一步做增強掃描。