結核桿菌DNA陰性是指患者的體液中，檢測的結核桿菌DNA沒有超過正常的區間，即＜500copies/mL。檢測結果為陰性，應結合其他的臨床癥狀進行分析，從而判斷患者是否被結核桿菌感染。因為結核桿菌DNA檢測陰性，不一定預示著體內沒有結核菌存在，僅提示低于正常的檢測值。一旦體內存在微量的結核菌感染，結核桿菌可在短時間內進行繁殖，此時再次檢測結核桿菌的DNA可能呈現陽性。所以應結合臨床癥狀以及其他檢測指標進行分析，必要時需要復查結核桿菌，此時才能確定患者是否感染結核桿菌。若患者確診結核桿菌感染，需要進行抗結核治療。