結核桿菌陰性是檢測病人標本，其結核桿菌DNA的含量＜500copies/ml。但從另一方面，結核桿菌陰性并不一定代表病人一定正常，因為其一定表現出相應的結核病方面的癥狀，所以大夫才讓其到檢驗中心查該試驗。 因為病人體內的結核桿菌含量相對較低，沒有達到PCR儀器的檢測下限，或者感染早期結核桿菌基因的復制，還沒有達到一定量，沒有達到500copies/ml，沒檢測到，即現在醫學上所說的窗口期。這種情況建議患者根據臨床癥狀，進一步觀察，或者復查。