牙窟窿里長肉，根據不同原因選擇不同的治療辦法，具體情況如下：1、牙髓息肉：齲齒的齲洞中長出息肉樣改變，通常是牙髓中的牙髓息肉，此時通常應該由牙體牙髓科醫生進行標準的牙體治療，方可起到較好的治療效果；2、牙周組織息肉樣改變：如牙齦炎、牙周炎導致息肉狀改變，此時需在標準的牙周治療基礎上選擇必要的外科手術，進行牙周息肉切除，才能起到較好的治療效果；3、牙齦瘤增生樣改變：需要選用個性化治療方案，如外科手術切除，同時需警惕牙齦良性或惡性腫瘤；4、頜骨內囊腫或腫瘤樣病變：侵犯牙齦后也可出現牙齦上腫物，患者會誤認為是牙上長的增生物，需由專科醫生制定個性化治療方案，方可取得較好的治療效果。