輔酶Q10在臨床中常會給心肌炎的患者應用，其能進行氧自由基的清除，對心肌炎的改善有幫助，同時會給心肌修復提供一定的原料，幫助心肌進行恢復改善。如果服用很高劑量的輔酶Q10，偶爾可見胃腸道反應，比惡心、嘔吐、腹瀉等等，幾乎僅見于文獻報道，在臨床中非常的少見。輔酶Q10是安全性非常好的藥物，即使很大劑量服用，胃腸道吸收不后藥物就會被排泄掉，所以幾乎見不到副作用。偶爾能見到的文獻的報道有輕微的消化道的反應，包括惡心、嘔吐、腹瀉等，還有極少一部分的人群會出現輔酶Q10過敏，這個時候可能表現為身上會有皮疹、藥疹，當停藥之后或者聯合服用抗過敏的藥物治療之后就會得以改善。