臨床上治療頭疼的穴位比較多，主要是位于頭部，也有一部分位于軀干部以及手足，具體如下：1、頭部穴位：如果頭疼以面部的疼痛為主，則稱為陽明經頭痛，臨床上應用較多的穴位是印堂穴、神庭穴、上星穴、頭維穴等。如果頭疼以后頭部，即頭枕部疼痛為主，一般使用較多的穴位，如玉枕穴、腦戶穴、腦空穴、風池穴、天柱穴、風府穴、啞門穴等。部分患者表現為側頭部疼痛較明顯，即頭的偏側、外側面疼痛，此時臨床上多使用率谷穴，部分患者疼痛多表現為頭頂部疼，即巔頂疼痛，臨床多使用百會穴、四神聰穴、前頂穴等；2、上肢穴位：通常在頭部穴位取穴的同時，還會配合上肢穴位，如列缺穴，四總穴歌中的一句話為頭項尋列缺，表明頭頸部的多種疾病，臨床上都可以選擇列缺穴治療；3、下肢穴位：下肢腳上可以選擇太沖穴，也是臨床上出現頭疼后，配合使用較多的一個穴位。