腦梗在急性期可以使用的藥物有抗血小板聚集的藥物，如阿司匹林、氯吡格雷等，也可以使用降脂穩定斑塊的藥物，如他汀類藥物，以及對于急性期改善預后有一定效果的藥物，如丁苯酞等。腦梗的二級預防就是長期服用的藥物是預防腦梗二次復發的，服用的藥物和腦梗的病因有關，如果是動脈粥樣硬化引起的腦梗，長期服用的藥物包括抗血小板聚集的藥物，還有使用他汀類藥物穩定斑塊，強化降脂治療。如果是房顫導致的腦栓塞，在二級預防的情況下，需要評估是否需要進行口服抗凝藥的治療，防止房顫、腦栓塞的發生。也有部分患者，腦梗和免疫系統引起的血管病變有關，需要針對病因進行結締組織病的治療。也有部分患者腦梗可能和心臟的結構異常，比如卵圓孔未閉等有關，這些患者可能更重要的是需要針對病因，比如針對卵圓孔未閉，請心臟外科的專家進行評估，是否需要進行封堵治療等。