海馬硬化的原因比較多，具體見于以下幾方面：1、發熱：兒童發熱以后，容易導致海馬皮質的破壞，時間久后會出現海馬硬化的狀況；2、腦炎：部分病毒性腦炎，也會導致海馬腦皮質的損害，出現海馬硬化；3、癲癇發作：癲癇發作以后，會造成相關區域的神經元，尤其是顳葉癲癇會造成海馬的神經元缺失，時間久后會造成海馬硬化的結果。還有一部分認為海馬硬化也會導致癲癇發作，這兩個互為因果；4、外傷：大腦受到外傷以后，導致局部區域的缺血、缺氧，或神經元的損傷，出現海馬硬化的后遺癥；5、其他因素：缺血、缺氧，還有低血糖等這些因素，會造成大腦的皮層造成損害，最容易受損的部位就是海馬，還有額葉的皮質。顳葉和額葉都出現損害，所以最容易出現損害就是海馬這個部位，出現缺血、缺氧和低血糖以后，反復發作會出現海馬硬化的現象。