唇腭裂尤其是唇裂給人的第一感觀就是影響美觀，因為上唇是裂開的，部分會影響到鼻的畸形，還有一些畸形包括面側裂、面斜裂等，都屬于頜面部先天性發育畸形。這些疾病從外觀上首先是影響美觀，如果有腭裂有口鼻腔的相通會影響進食，進食會嗆咳。在嬰兒期不能吸吮奶瓶或者乳房，因為不能形成負壓，所以對進食會造成困難嗆咳。患兒到了語音發音的時候，一歲左右的時候發音不清楚，如果不做矯正發音無法改善。牙頜的畸形即牙列排列不整齊，或者牙齒的數目有缺失，稱為牙頜畸形，這樣對患兒的牙齒外形美觀還有咀嚼功能，遠期顳頜關節的功能都有比較嚴重的影響。腭裂患者會有聽力障礙，因為耳咽管是畸形的，在遠期以后，從患兒懂事開始接觸小朋友以后走向社會，心理會有障礙，影響到社會交往和正常的工作和學習等等。