唇腭裂通常在懷孕的前3個月，即12周前形成，主要的形成時間為懷孕3-8周。如果孕產婦在懷孕期間缺乏維生素A、維生素B以及葉酸，均可能會導致胎兒唇腭裂。環境因素以及致病因素的作用，可能也是引起唇腭裂的主要原因。孕產婦在孕期缺乏維生素A、維生素B、葉酸，或由于抽煙、喝酒以及食物過敏或有毒因素的作用，可能導致胎兒在發育的重要時期，即前3個月時導致胎兒唇腭裂。所以在懷孕早期建議孕產婦遠離毒物、有毒環境或裝修的刺激性氣體，上述致病因素均可能會造成胎兒唇腭裂或其它畸形。在早孕期間建議孕產婦按醫生囑托積極補充葉酸，可以幫助預防神經管畸形以及唇腭裂。