囊腫的治療方法很多，包括針刺法、針吸法、針灸法、掛線法以及擠破法，但這些治療方法復發率一般都較高。臨床上發現，在3-6個月之內的囊腫，通過擠破方法可以治療囊腫，但一般有40%-50%的復發率。針對3-6個月以上的囊腫，一般建議通過手術來治療，找到囊腫壁，順著囊腫壁找到蒂部，從而發現關節腔的破口，進行囊腫的完整切除，將關節囊壁縫合，后期病人可依靠瘢痕愈合。囊腫通常也不會再復發。有文獻報道手術方法也存在30%-40%的復發率，但目前病人治愈率還是比較高的。