任何的治療都有兩面性，尤其是在醫學領域，手術容易產生后期疤痕，藥物也有可能會有副作用，正畸治療也是一樣的，也可能存在一定的后遺癥，具體內容如下： 1、對于牙髓阻滯，在正畸治療初期，牙髓可能發生一定或者輕微的炎癥反應，這種炎癥反應一般不必擔心，它會自行恢復，主要表現為牙齒酸疼和不適； 2、對于牙根的影響，在正畸治療過程中，牙根會隨著牙齒的移動發生牙根表面的吸收和重建，這都是非常正常的生理現象，正畸結束治療之后，大部分會自行修復，但是如果進行了不當的加力，有可能會加重牙根吸收； 3、牙槽骨的影響，在正畸治療過程中，很有可能會造成牙槽骨吸收，原因就是在正畸治療過程中，牙齦牙周組織的口腔衛生保持的不是很好，加重了牙齦病和牙周病的發生概率，當然口腔衛生保持好的情況下，一般不會出現該現象； 4、牙齒松動，正常的牙列牙齒是有一定松動度的，這是為了緩沖咬合的壓力，在正畸治療過程中牙齒進行了一個輕微的移動，在正畸過程中出現輕微的移動松動是非常非常正常的，一般在正畸治療結束后牙周膜會自行恢復，但是如果進行了不當的加力，牙根吸收的風險就會大大的增加。