孩子陰莖小應先明確原因，觀察為小陰莖還是隱匿性陰莖，根據不同原因進行治療。主要分為以下幾種情況：1、小陰莖：部分陰莖小是發育問題，如陰莖體發育纖細，觸摸發現陰莖體不但纖細而且短小，外觀上也短小。用手推擠包皮后，發現陰莖已充分外露，充分外露后仍然短小，此種情況稱為先天性小陰莖，可能需要小兒內分泌科醫生進行治療，進行頭顱垂體磁共振或激素相關方面檢查；2、隱匿性陰莖：若孩子陰莖小，僅為外觀小，但陰莖體發育正常，用手觸摸或擠壓包皮后，可發現陰莖體大部分埋藏于皮下或包皮內，擠壓后即可看到正常陰莖體，孩子可能為隱匿性陰莖。隱匿性陰莖使陰莖體大部分埋藏在皮下，周圍筋膜充分包裹或束縛，陰莖體不充分外露。根據孩子年齡，如3-6歲可選擇手術治療，將陰莖體周圍充分的游離，將包皮脫套，陰莖體充分釋放。釋放后，將陰莖體根部固定，同時進行包皮口成形，使其達到接近正常外觀，并不影響以后生長發育及孩子心理健康。