骨髓移植也就是造血干細胞移植，顧名思義，自體造血干細胞移植就是用自身的干細胞來移植，也就是重建造血。在臨床工作上，會通過大劑量的化療來清除體內的殘留腫瘤細胞，同時輸注自體干細胞以重建造血。自體造血干細胞移植主要適用于一些干細胞采集物未被腫瘤細胞累及，可以采集到足夠數量造血干細胞的惡性腫瘤患者，或者是自身免疫性疾病患者。比如對于急性髓系白血病低危組病人，患者第一次完全緩解之后，一般在達到CR1后鞏固2-3個療程就可以采取自體造血干細胞移植。首選是骨髓，但是目前臨床工作上更多的是采取外周干細胞，3年無病生存率自體干細胞移植可以達到40%-50%。對于一些中危組或者復發急性早幼粒細胞白血病的患者，如果沒有配型相合的同胞供者或者無關供者，微小殘留白血病檢測達到陰性之后，也可以考慮行自體造血干細胞移植。同樣符合條件的疾病還有急性淋巴細胞白血病，在急淋的應用方面比較有限，還有非霍奇金淋巴瘤中的彌漫大B細胞淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、濾泡淋巴瘤、外周T細胞淋巴瘤以及霍奇金淋巴瘤、多發性骨髓瘤、自身免疫性疾病，還有其他實體性腫瘤等。