腸胃炎發作時，疼痛主要出現于上腹或臍周。腸胃炎主要表現，并非以腹痛為主，腹痛相對比較輕微，除非合并嚴重胃腸道痙攣，此時可有明顯上腹疼痛或臍周疼痛。大部分腸胃炎主要表現為惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀，胃炎可伴明顯惡心、嘔吐，腸炎可能伴腹瀉，通常為黃色稀水便，不會有明顯黏液膿血便。通常急性腸胃炎病程相對較短，數天內即可緩解，如果持續時間相對較長且遷延不愈，還應考慮其它病情可能性，需注意進行排除。如惡心、嘔吐、腹瀉、腹痛等癥狀，需與多數急腹癥相鑒別，如急性闌尾炎、急性膽囊炎等。