肺炎鏈球菌首選抗生素為青霉素，具體如下：1、青霉素：包括一代青霉素，還可使用廣譜半合成青霉素以及其他抗生素，如阿莫西林或加入抗青霉素酶的聯合抗生素，如阿莫西林克拉維酸鉀；2、頭孢菌素：一代頭孢菌素對于肺炎鏈球菌效果較好，但第二代、第三代頭孢菌素及氨基糖苷類抗生素，如慶大霉素等，對于肺炎鏈球菌療效不佳；3、其他抗生素，如四代喹諾酮類莫西沙星等，對于治療肺炎鏈球菌，效果較好。肺炎鏈球菌在我國耐藥情況相對較廣泛，但屬于中度耐藥，即通過增大青霉素或者相應抗生素使用量，可以將耐藥的肺炎鏈球菌殺滅。