扁桃體炎引起口臭可以根治，但需根據扁桃體炎控制情況而定，若控制較好通常口臭可以根治。若慢性扁桃體炎患者沒有頻繁發作，僅表現為扁桃體腺窩內有分泌物和角化物質，患者可每天早晚使用淡鹽水漱口并保持咽腔內清潔。飲食方面盡量減少油膩和辛辣刺激食物攝入，多飲水、多食用新鮮蔬菜水果和蛋白含量豐富食物，以增強機體抵抗力。通過上述措施可有效緩解癥狀，若患者可以避免反復感冒，則扁桃體炎也不會反復發作，扁桃體慢性炎癥也會逐漸得到好轉，使口臭情況得到改善或根治。但如果扁桃體炎反復發作，患者每年扁桃體化膿水腫且高燒情況超過5次，可能對身體造成損害。同時口臭情況也不會得到緩解，因而建議患者行手術切除，術后由扁桃體炎所導致的口臭便可得到根治。