胃賁門炎的癥狀主要包括反流性食管炎導致賁門粗糙，而引起的臨床癥狀。部分胃賁門炎患者的癥狀與反流性食管炎的癥狀相同，主要表現為反流，胃、十二指腸的內容物反流到食道內，引起的不適感。還可能出現燒灼，好比吃辛辣刺激性食物所導致的燒灼感。部分比較輕度的賁門炎可以沒有任何臨床表現，往往是內鏡檢查發現賁門口黏膜粗糙而確診，臨床上沒有特異性表現。部分胃賁門炎患者以消化不良、胃動力異常為臨床表現，可以表現為上腹隱痛，進食后飽脹感及納差。胃賁門炎的主要癥狀不同，治療也有所差異。如果以反流性食管炎為主要癥狀，主要是抑酸治療。如果以消化不良為主要癥狀，主要是促動治療。