先天性室間隔缺損部分可以自愈，尤其膜部室間隔缺損和肌部室間隔缺損，在3-5mm內，自愈機會比較大，自愈時間在兩歲內，超過兩歲沒有愈合，愈合可能性不大。兩歲內的等待時間，家長一定帶患兒到醫院定期復查，以免出現室間隔缺損擴大或者心臟其它問題，沒有及時發現。 室間隔缺損隨訪過程，家長要每3-6個月帶孩子到醫院接受檢查，密切觀察缺損大小變化以及心臟異常情況出現。部分孩子可因為室間隔缺損導致心臟感染，出現心內膜炎，這種情況需要盡早接受手術治療。室間隔缺損雖然能夠自愈，但是隨訪非常關鍵，不能為等待自愈不去醫院就診，這樣可能貽誤治療。