臨床室間隔缺損總體自愈幾率占21%-63%，自愈可能性通常與室間隔缺損位置、大小以及年齡具有較大相關性。相對于膜部和肌部室間隔缺損在5mm以下均存在自愈可能性。 但是對于干下型與嵴內型室間隔缺損多無自愈可能性，通常年齡越小患者自愈可能性則越強。隨著年齡增長，自愈可能性則會逐漸降低，一般長到5-6周歲以后，就基本失去自愈機會。 對于有血流動力學改變的室間隔缺損，一般情況下無閉合可能性，建議5-6周歲以后手術治療。