室間隔缺損是否自然愈合，影響的因素非常多。主要取決于室間隔缺損的位置，以及室間隔缺損的大小。對于某些位置的室間隔缺損，如肺動脈瓣下、雙動脈下，或者對位不良型的室間隔缺損、比較大的肌部室間隔缺損，很難自然愈合。對于膜周部位的缺損，如果室缺的不大，不超過5mm，非常小的室缺，由于周圍有三尖瓣的隔瓣組織，有可能形成超聲上所見到的描述，如假性室隔瘤形成。當假性室隔瘤分流口比較集中，如有分流口，而且在隨訪的過程當中，分流口在逐漸減小，這類室缺有可能發生自然愈合。