患者誤將扁桃體結石吞咽，無需過于擔心，也不需要進行處理。少量結石進入胃內，不會引起明顯胃部不適或胃部炎癥等，可能經過一段時間后會隨糞便排出。但如果患者常將扁桃體結石吞咽到胃內，可能會將扁桃體炎癥帶入食道或胃內，引起食管炎或胃炎。因此，患者應盡量減少結石產生，可應用漱口液漱口并鍛煉身體，減少扁桃體炎發作。通過上述簡單方法無法改善癥狀時，建議盡快將扁桃體切除，從根本上解決結石情況。扁桃體切除后對于機體抵抗力，尤其是成人抵抗力不會產生較大影響，因成人扁桃體免疫功能基本不存在。