藥流肚子比較疼，一般疼痛度是痛經的2-3倍，大部分患者可以耐受，輕于人工流產導致的疼痛。人工流產導致的疼痛大概是痛經的5-6倍，甚至更多。藥流第1天給予米非司酮，第3天給予米索前列醇。藥流第1天給予孕激素拮抗劑米非司酮，促使孕囊松動，服用米非司酮一般不會出現腹痛，通常沒有任何藥物反應，極少數女性服用米非司酮后出現陰道出血，甚至見到孕囊排出。如果服用米非司酮后，已經見到孕囊排出，不需再服用米索前列醇。藥流第3天服用宮縮劑米索前列醇而誘發宮縮，引起明顯腹痛。一般服用米索前列醇后15-20分鐘開始出現宮縮腹痛，宮縮腹痛持續幾個小時后可以見到孕囊排出，如果孕囊排出，2周后復查B超以判斷是否存在宮腔殘留。