最常見的內鏡檢查包括胃鏡和腸鏡，胃鏡是從嘴中插管，經過咽部、食管到胃進行觀察。腸鏡是從肛門進行插管，從肛門到直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸，一直到盲腸，再到小腸的末端進行觀察。腸鏡是先到最里面然后倒回來查看。胃鏡在漸進過程當中要觀察，到十二指腸最深的位置或者退回來，慢慢的仔細觀察。做胃腸鏡時，每個人的敏感程度不同，有些患者會感到痛苦，如做胃鏡時可能會有惡心的感覺，做腸鏡時可能會有腹痛的感覺。在檢查的過程中，如果感覺比較難受，可以選擇做無痛胃鏡檢查，無痛胃鏡檢查跟普通胃鏡的檢查做法一樣，區別在于無痛胃鏡會使用全麻藥物，做檢查時患者就像睡著了，感覺不到疼痛，所以不會有難受的感覺。胃腸鏡檢查對身體影響很小，不會出現不適的癥狀，所以無痛胃腸鏡檢查是排查腸道的息肉、腫瘤病變、胃里面早期的腫瘤病變、明確有無潰瘍炎癥，目前最好的檢查手段和方法。