一般情況下椎動脈起始于雙側鎖骨下動脈，起始位置叫起始段。起始段因跟鎖骨下動脈有分叉，所以起始段是最常出現病變的一段。檢測過程中，起始段發生閉塞或重度狹窄幾率高。 起始段進入第六頸椎橫突孔之前的稱為V1段，叫做頸段。V2段叫橫突段，是從第六橫突孔一直上行至第二橫突孔段。V3段從第二頸椎橫突孔出口伸向脊椎段，叫做寰椎翻轉，根據生理結構寰椎翻轉彎曲可以轉。V4段是顱內段，就是從硬腦膜孔穿梭至基底動脈起始段，叫V4段。