慢性呼吸衰竭多由支氣管肺疾病引起，例如肺結核、肺纖維化、肺間質纖維化、塵肺、支氣管擴張等。同樣也可以由胸廓和肌肉的病變引起，例如胸廓手術、胸廓畸形、胸膜嚴重增厚、脊髓側索硬化癥等，所以慢性呼吸衰竭的疾病通常是支氣管肺疾病以及胸廓和神經肌肉疾病引起的，其中支氣管肺疾病最為常見。對于慢性呼吸衰竭的治療，氧療措施與急性呼吸衰竭一致，氧療的目標就是要使動脈血氧分壓達到60mmHg以上。但是對于慢性氣道疾病的氧療，通常應用的是低流量吸氧的方式，因為氧濃度增高會導致外周感受器刺激下降，會導致二氧化碳潴留的發生。除了氧療之外，還可以進行正壓通氣。另外，還有最重要的就是要積極治療原發病，對于慢性呼吸衰竭的治療是根本的。