一般沒有夫妻染色體不合的說法，而是存在夫妻雙方每次懷孕，胚胎染色體異常總會出現問題，或者出現問題的風險比較高。此種情況首先需要觀察夫妻雙方是否存在染色體結構異常，尤其是平衡易位、羅氏易位這種相對比較常見的結構異常。由于平衡易位或者羅氏易位并不存在著遺傳物質的顯著增加或者缺失，所以存在此種結構異常的人通常沒有任何的異常表現，身體發育以及智力發育都正常。但是在懷孕的時候胚胎染色體異常風險顯著增加，因此會表現為反復的自然流產、胚胎停育。一般建議通過第三代試管嬰兒的方式做胚胎挑選，選擇染色體正常的胚胎來移植，從而降低流產、死胎、畸形的風險。另外還有一部分夫妻雙方染色體正常，但是由于高齡，尤其是女方高齡，存在著每次懷孕染色體異常的風險增加。也可以通過三代試管嬰兒的方式，對胚胎進行挑選，來降低每次懷孕發生異常妊娠的風險。