肛瘺是肛門直腸周圍膿腫破潰后形成的瘺管，通常是由內口、外口、瘺管組成。內口通常位于齒狀線附近，外口在肛門周圍5cm以內的肛周皮膚上，中間有瘺管相通。肛瘺起源于肛旁腺正常肛管內的齒狀線，齒狀線上有肛竇，肛竇開口朝向直腸和上方，腸內容物通過時肛竇可積存腸內容物。如果腸內容物積存不能排出，可以引起與肛竇相通的肛旁腺炎癥。肛旁腺炎癥進一步發展，會形成肛門直腸周圍膿腫，膿腫在破潰后形成肛瘺。肛瘺會由肛竇處的內口順肛旁腺瘺管，出現破潰外口。根據肛瘺瘺管走行可以分為高位肛瘺和低位肛瘺，高位肛瘺的瘺管走行涉及到肛門括約肌，手術時需部分離斷括約肌，高位肛瘺通常采用掛線療法，慢慢離斷括約肌。括約肌離斷時周圍形成黏連，不會造成括約肌回縮和肛門失禁。低位肛瘺可以將瘺管剔除或直接將瘺管切開，搔刮瘺管壁。