射精過后小便刺痛最常見于前列腺炎、尿道炎、后尿道結石等，建議應及時到泌尿外科就醫。具體原因如下：1、前列腺炎：病人發生慢性前列腺炎時，由于感染性致病菌刺激前列腺部尿道黏膜引起黏膜水腫、糜爛，還會引起前列腺腺體發炎，導致腺管和腺體發生炎性腫大。另外感染性致病菌還會波及射精管開口，引起輸精管發炎，導致精液感染。在射精時由于致病微生物刺激后尿道糜爛的黏膜，病人就會出現后尿道刺痛癥狀，出現射精后小便刺痛癥狀；2、尿道炎：尿道炎的病人由于感染性致病菌刺激尿道黏膜，引起黏膜水腫、糜爛。在射精時由于精液刺激糜爛的尿道黏膜，會引起尿道出現刺痛癥狀，部分病人還會出現尿道灼熱癥狀；3、后尿道結石：后尿道結石的病人由于結石劃破后尿道黏膜，導致黏膜破損，在射精時，由于精液刺激破損的尿道黏膜，也會出現射精后尿道疼痛癥狀。