射精后腰痛最常見于慢性前列腺炎，病人發生慢性前列腺炎時，由于感染性致病菌，刺激前列腺部尿道黏膜，會出現黏膜紅腫、糜爛，導致前列腺腺體炎性腫大。還會導致致病微生物，通過射精管開口引起精液感染，導致精液內大量致病微生物繁殖，引起輸精管走行區不適癥狀。病人還會在射精后，精液進入后尿道后，大量致病菌刺激后尿道黏膜，導致黏膜水腫、糜爛，出現局部疼痛癥狀。病人出現射精后疼痛癥狀時，需及時到泌尿外科或男科就醫，通過精液細菌培養，精液支原體、衣原體培養，通常能找到致病微生物。通過選擇有效的抗生素和中成藥物聯合治療，如磷霉素氨丁三醇散，配合熱淋清顆粒治療，多數病人射精后疼痛癥狀明顯好轉。射精后疼痛癥狀，還可以口服鹽酸米諾環素，配合八正膠囊治療，多數病人在口服上述藥物治療后，射精后疼痛癥狀會明顯好轉。