無癥狀菌尿最常見的病菌是大腸埃希氏菌，即大腸桿菌。其他致病菌包括其他腸桿菌科的細菌，如奇異變形桿菌、肺炎克雷伯菌、銅綠假單胞菌以及一些革蘭氏陽性球菌，包括糞腸球菌、屎腸球菌、鏈球菌、金黃色葡萄球菌等細菌共同構成無癥狀菌尿的常見感染菌種。無癥狀菌尿常發生在泌尿系統有異常的患者及絕經后的女性，大多數患者并沒有明顯癥狀，只有在化驗時才能查出有菌尿。對于此類患者，包括妊娠期的女性以及要進行泌尿外科手術的患者，建議進行積極治療。因為一旦轉化為感染，將會造成比較嚴重的后果。而對于其他的患者，如老年人、兒童、長期留置尿路導管的患者、糖尿病患者、腎移植患者等，如果沒有明顯感染癥狀，對于無癥狀菌尿可以不進行特殊治療。