寶寶大便酸臭，主要是由于糞便存積在腸道的時間過長，如進食較多而排便不暢時會導致糞便無法及時排出，不消化的食物在腸道內積累發酵，不僅會導致寶寶口臭，也會使糞便出現酸臭味。若寶寶每天進食的食物無法得到及時消化，糞便即可出現酸臭味，還會出現腹痛、腹脹甚至嘔吐等不適表現。若寶寶進食過多但排便正常，可能存在較好的代謝。但若排便不佳，則即使未進食過多食物，也會引起積食。若任由酸臭味糞便發展，則毒素可能會被寶寶的機體吸收而導致發燒等癥狀。