男性尖銳濕疣多半長在龜頭、尿道口、陰莖、陰阜部位，甚至在肛周、肛管內。典型癥狀為外陰生殖器出現凸起的異物，觸感稍硬、表面呈刺狀，建議到醫院進行檢查。對于包皮過長的男性往往在包皮內有白色的分泌物，往往擦掉包皮垢之后其內可見紅色的小丘疹、小疙瘩，可能是早期尖銳濕疣的癥狀，所以男性包皮過長、有刺癢癥狀時要注意。 對于男性尖銳濕疣還要注意長在肛門周圍和肛管內的尖銳濕疣，長在肛管內的尖銳濕疣如果是高危型造成，治療不及時可能會引起肛門癌變，所以男性尖銳濕疣多半就是因為其生殖結構的原因，在洗澡的過程中前后的摸一摸，如果長出疙瘩，尤其不安全性行為時，建議到醫院進行檢查是否有典型的菜花狀、乳頭狀、雞冠狀的凸起。