男性尖銳濕疣治療的總體原則，首先去除疣體，如果有可能再把病毒清除，是兩個治療的目標。在去除疣體上，有物理性手段、化學性手段、生物免疫、中醫中藥等。清除病毒可用外抹干擾素咪喹莫特，甚至服用整體提高免疫力的藥物去除病毒。 如果患者在家用藥去除疣體，一定要保護好正常的皮膚黏膜。但是對于復雜的潮濕環境中比較大的疣體，不建議自行用藥，容易把簡單的病弄成復雜化。對于復雜不太好辨認的疣體，建議到專業機構由專業醫生進行處理。