腹腔灌注化療主要應用于卵巢癌、胃癌，或者其他消化道腫瘤轉移到腹膜，然后導致腹水的情況，其副作用主要有以下幾種：1、腹腔穿刺點出血：腹腔灌注化療需要穿刺，藥物直接進入腹腔，因此會有腹腔穿刺點出血的可能，如果穿刺到比較大的血管，會出現比較難以止住的出血；2、腹痛、腸穿孔：化療藥物直接作用于腹膜和腸管表面，可能會給病人造成嚴重副作用，嚴重的可能會造成腸穿孔。而腹膜和腸管表面的神經系統相對豐富，大部分病人經過腹腔灌注化療后，會出現比較嚴重的腹痛；3、腸道粘連：腹腔灌注化療對腸管、腹膜會造成一定的影響，會抑制腹水的生成，可能會產生輕度炎癥，容易導致腸道粘連；4、骨髓抑制即：白細胞下降、血小板下降或者貧血等。腹腔灌注化療的副作用較大，通常配合全身的靜脈化療使用。