口腔黏膜科主要是看口腔軟組織上發生的一組疾病，如潰瘍類疾病，包括復發性口腔潰瘍、創傷性潰瘍等。還有皮膚黏膜病，包括扁平苔蘚、天皰瘡等，潛在惡性疾病包括口腔白斑、黏膜下纖維性變等。此外舌炎、唇炎，如溝紋舌、地圖舌、灼口綜合征、舌疼癥、嘴唇起皮、慢性唇炎等。還有較常見的過敏性唇炎、過敏性口炎，包括藥物過敏性口炎等都可在口腔黏膜科看。口腔黏膜科主要是治療口腔黏膜的一組軟組織疾病，一般治療手段為藥物治療。如唇皰疹為口腔發生病毒感染、念珠菌感染導致鵝口瘡等，都是口腔黏膜科診治的疾病，總共多達200多種。常見的包括潰瘍類疾病、大皰性疾病、斑紋類疾病、口腔黏膜潛在惡性疾病、皮膚黏膜病。還有感染，如單純皰疹病毒感染、真菌感染、細菌感染等，引起口腔黏膜的疾病，都可在口腔黏膜科就診。