尿路結石的治療可分為上尿路結石的治療和下尿路結石的治療。上尿路結石主要是腎和輸尿管結石，治療包括自然排石，通常適用于直徑＜6mm的結石。而且表面光滑，下尿路無梗阻，在局部停留時間少于2周，以胱氨酸結石或者尿酸結石為佳。如果結石體積較大，如輸尿管結石＜1cm，或者腎結石＜2cm，還可以考慮體外沖擊波碎石。體外沖擊波碎石是一個安全、簡單、有效的治療手段，通常在門診就可進行。但是對于一部分結石，如腎下盞結石，碎石效果欠佳，以及結石越大，碎石效果越差，可以考慮行輸尿管鏡或者輸尿管軟鏡的治療。如果結石體積相對較大，超過2cm，考慮行經皮腎碎石取石手術或者開放手術。目前開放手術或腹腔鏡手術已經不再是結石治療的主要方法，目前主要是內鏡下治療。下尿路的結石包括膀胱結石和尿道結石，其治療的主要方法是內鏡下治療。