男性的精子有異味，常見于以下幾種情況：1、淋菌性尿道炎：這種情況最常見于淋菌性尿道炎，男性發生淋菌性尿道炎時，如不及時治療，會出現致病微生物逆行感染，引起淋菌性前列腺炎，進而沿射精管開口引起輸精管感染，引起精液發生淋球菌感染。男性會出現精液發黃和射精疼痛癥狀，還會出現精液呈惡臭氣味；2、生殖道糞腸球菌感染：男性發生生殖道糞腸球菌感染時，也會出現尿頻、尿急、尿痛的癥狀，部分男性還會出現精液中有惡臭氣味；3、生殖道滴蟲感染：男性發生滴蟲性尿道炎時，如經久不治，會導致滴蟲沿射精管開口引起精液感染，會導致精液中發生滴蟲感染。男性會出現下腹部隱痛和發癢癥狀，部分男性會出現射精時精液有異味的癥狀。