腎病綜合征分為原發性和繼發性，乙型肝炎病毒是腎病綜合征很重要的原因，此時腎病綜合征治療有兩個方法，一是處理乙型肝炎病毒，用干擾素、拉米夫定、恩替卡韋，患者在清除乙肝病毒后腎病就可以好轉甚至蛋白尿完全消失。 但是部分患者清除乙肝病毒后腎病沒有緩解，在肝功能正常、充分抗病毒治療的情況下，可以給予糖皮質激素，甚至細胞毒性藥物治療，如嗎替麥考酚酯，此類患者治療風險相對較高。 所以，乙型肝炎病毒引起的腎病綜合征治療可以是激素加細胞毒性藥物，但在治療過程中要嚴密監測乙肝病毒復制量，即HBV、DNA定量，同時嚴密監測肝功能。