宮頸癌四價疫苗應用安全性較受肯定，多數患者注射宮頸癌四價疫苗后，并不會有任何臨床癥狀及不適。但少數患者可能會出現影響，癥狀如下：1、局部癥狀：部分患者在注射局部可出現皮疹、硬結，可伴有輕微壓痛。多數局部不良反應無需過于擔心，隨時間延長，很快可自然消失；2、全身癥狀：部分患者注射宮頸癌四價疫苗后，可能出現全身反應，如發熱、寒戰、咳嗽、皮疹等，嚴重時患者可出現需要醫學救治的過敏反應。但大部分患者注射宮頸癌疫苗后，并無非常明顯的臨床不適癥狀。除此之外，宮頸癌四價疫苗針對兩種高危亞型HPV16和HPV18，以及兩種低危亞型HPV6和HPV11導致的相應疾病。四價疫苗能夠預防大約70%的宮頸癌，不能預防所有宮頸癌的發生。因為沒有針對所有高危亞型的人乳頭瘤病毒，所以對于高危亞型人乳頭瘤病毒的受限，決定未來依然有可能會發生宮頸癌以及癌前病變。因為宮頸癌四價疫苗所針對的兩種低危亞型HPV6和HPV11是導致尖銳濕疣發生的較常見病因，在注射四價疫苗后，能夠預防多數尖銳濕疣的發生。因此在未來仍需要定時進行宮頸癌篩查，不能因為注射四價疫苗，完全否認有患宮頸癌及癌前病變的風險。