女性囊腫一般多發于宮頸以及附件，附件包括卵巢和輸卵管，其中宮頸納氏囊腫在臨床上較為多見，一般為良性囊腫。如果納氏囊腫較小，沒有影響經血流出，或占據整個陰道壁的情況，通常不做特別處理，而單發的宮頸囊腫，一般視為良性囊腫，也不做特殊處理。此外，輸卵管的系膜囊腫也比較常見。較小的系膜囊腫一般通過B超無法觀察，更多是術中偶然發現，一般不會影響患者身心健康，以及日后懷孕。如果婦科醫生在手術當中，偶然發現輸卵管外的囊腫，或長于輸卵管系膜的囊腫，一般會一并將其摘除。此時囊腫多半為良性，可能不會對患者造成影響。卵巢是容易發生囊腫的位置，且卵巢囊腫的性質較多，如生理性囊腫、黏液性囊腫、漿液性囊腫、巧克力囊腫，以及畸胎瘤內油脂較多的囊腫。如果B超、體檢時發現囊腫，根據囊腫生長的部位、良惡程度以及大小，結合具體情況，醫生可給予明確診斷意見。